目前自闭症尚无法治愈，但早期的治疗干预能让自闭症儿童得到较好的康复。对自闭症患者的治疗通常以教育干预为主，药物治疗为辅。
教育干预的目的在于改善核心症状，同时促进智力发展，培养生活自理和独立生活能力，减轻残疾程度，改善生活质量，力争使部分患儿在成年后具有独立学习、工作和生活的能力。
因自闭症患者存在多方面的发育障碍及情绪行为异常，应当根据患儿的具体情况，采用教育干预、行为矫正、药物治疗等相结合的综合干预措施。
行为疗法
研究证明系统强化行为治疗法（如加强互动和有意义的交流），对自闭症患儿大有益处。精神心理医生和教育工作者，通过行为分析，系统地根据不同的行为问题采取相对应的行为治疗，有助于在家中和学校管理患儿。
药物治疗
药物治疗有助于缓解症状。有证据表明，非典型抗精神病药物，有助于缓解行为问题，例如仪式性、自我伤害性和攻击性行为。
其他药物有时用于控制特定症状，包括用于仪式性行为的SSRI，用于自身损伤和突发行为的情绪稳定剂，以及用于注意力不集中的兴奋剂和其他注意缺陷/多动障碍。
需要注意的是，0～6岁患儿以康复训练为主，不推荐使用药物。若行为问题突出且其他干预措施无效时，可以在严格把握适应证或目标症状的前提下谨慎使用药物。6岁以上患儿可根据目标症状，或者合并症影响患儿生活或康复训练的程度适当选择药物。
药物治疗对于儿童孤独症只是对症、暂时、辅助的措施，因此是否选择药物治疗应当在充分考量副作用的基础上慎重决定。且使用药物前必须向其监护人说明可能的效果和风险，在充分知情并签署知情同意书的前提下使用药物。
饮食干预
一些家长会尝试通过饮食、胃肠道治疗或免疫治疗改善症状，但没有证据表明这些方法对自闭症有效。其他补充疗法，如促进沟通、螯合疗法、听觉统合训练以及高压氧治疗，均尚未证明有效。
家长在采取其他治疗方法之前，应充分与专业医生进行沟通，了解治疗方法的预期效果及可能的风险。
总之，自闭症障碍会严重限制患者进行日常活动和参与社会的能力，往往对个人学业、社会成就及就业机会等方面产生巨大的负面影响。虽然一些自闭症患者经过治疗干预后，能够独立生活，但大多数自闭症患者需要终生护理。