如果处理不当，会导致小儿死亡或后遗症，如癫痫等。此外，小儿高热还会导致小儿电解质失调，发生脱水而引起酸中毒。
1.高热抽筋一般说6个月以内或6岁以上的孩子都不会因高热而引起抽筋，在1～6岁的孩子中也只有2～5%会发生这种抽筋。抽筋多发生于高热骤起之时，一次发热仅抽一次，很少超过2次以上，只要抽搐时间不长，处理得当，对孩子健康影响不大。但反复或持续的抽筋会引起脑缺氧而损伤大脑。
2."烧坏脑"一般发热对身体组织器官的影响不大，且能加速抵抗力的产生。当体温超过41°C时，体内蛋白质会发生分解，引起脑水肿而致病孩死亡或留下脑病后遗症。因此，孩子出现40°C以上高热就必须紧急处理。
3.脱水炎夏孩子通过呼吸与皮肤散发水分已比其它季节为多，苦遇发热就更多，体温每升高1°C，每公斤体重每小时散发的水分增加0.5毫升。因服退热药大量出汗时体内丧失水分就更多。脱水不仅使退热困难(在小婴儿脱水本身就可引起发热)，还会影响新陈代谢和血液循环，发生酸中毒等。因此对高热孩子必须鼓励饮水，必要时在医生指导下输液。
小儿高热惊厥有可能转为癫痫
高热惊厥在一般情况下预后大多数良好，但复发性的高热惊厥有转为癫痫的倾向。高热惊厥通常表现为全身性强直阵挛发作，不归属于癫痫综合征，但与癫痫的关系比较密切。