中医学上认为冲任二脉在一个人的身体中发挥着非常重要的作用机制，因为冲任二脉在人体中主要起着储存气血的作用，同时冲任二脉也是十二经脉存在的必要基础。冲任二脉在人体中可以将储存的气血运送给五脏六腑，以维持人体的正常生理机能。这时候就需要来认识到冲任二脉的具体位置。
1 冲任二脉的生理特性
冲任二脉皆起于下焦，二脉属于经络系统中的奇经，《灵枢・五音五味篇》中说道：“冲脉任脉，皆起于胞中，上循背里，为经络之海”。同其它奇经一样，冲任二脉也有着蓄溢气血，调节十二正经气血运行，并将蓄藏的气血输送给有关脏腑、组织的作用。但冲任二脉还有其特殊的功能作用，“冲为血海”、“任主胞胎”，冲任二脉在妇女的生理功能上起着很重要的作用。当女子生长发育到一定年龄阶段，肾气开始充盛，使得“任脉通，太冲脉盛”。并由肾精气化产生了天癸，天癸通过任脉而至胞宫，促使胞宫开始发挥其特殊的生理功能;同时冲任二脉还将蓄藏的气血输送至胞宫，在这样的条件下，才使得女子有了月经，从而标志着开始具备了生殖机能。由于经络以脏腑为本，并在实质上表现了脏腑的气化功能，所以冲任二脉虽属奇经，但同十二正经一样，其功能作用的发挥，是以脏腑的正常功能活动为基础的，而从冲任二脉的生理特性与有关脏腑的关系来看，尤与肝、肾、脾三脏的关系最为密切。
2 冲脉与肝肾的关系
“冲为血海”，肝主藏血，二者是紧密联系而不可分割的。一方面，肝有疏泄条达气机的作用，以保证气血的正常运行;另一方面，在肝的气化功能主导下，将体内一部分气血汇集于冲脉，以调节十二正经的气血运行，并供给有关的脏腑、组织。对于女子来说，正因为肝气的按时疏泄，将汇集于冲脉中一部分气血有时、有序、有度地输送至胞宫，从而为月经的产生准备了基本条件。冲脉生理功能的正常发挥，除了与肝有密切的关系外，还与肾气的推动作用有重要的联系。《内经・上古天真论》中说道：“女子，二七而天癸至，任脉通，太冲脉盛。”《内经・骨空论》中说到：“冲脉者，……，并少阴之经，挟齐上行，……”。肾气充盛以后，在。肾气的推动作用下，才使得“太冲脉盛”，并使冲脉同胞宫的特殊联系开始发挥作用。而冲脉的蓄藏气血，向胞宫输送气血，都要在肾气的协助下才能完成。如冲脉肾气充盛通盛肝气主导、肾气协助蓄藏气血肝气疏泄、肾气协助输送至胞宫。
3 任脉同肝肾的关系
任脉为“阴脉之海”，总任一身阴经。肾为藏精之所，在肾气主导下，任脉将肾藏的阴精向五脏六腑输注，以濡养脏腑;同时当女子发育到一定年龄阶段后，肾气开始充盛，通过肾气的推动作用，任脉同胞宫的特殊联系开始发挥作用，即产生了“任脉通”。于是肾精的气化物天癸通过任脉而至胞宫，促进胞宫的发育成熟，为胞宫的正常功能活动准备条件。在任脉的生理功能活动中，肝气的协助作用是很重要的，肝气的疏泄功能正常，有助于任脉的通盛;肝的藏血功能正常，任脉也才能保证蓄藏功能的正常发挥。而当肝的疏泄、藏血功能失常时，也会干扰、影响任脉生理功能活动的正常进行。如肾气充盛肝气协助任脉通盛肾气主导、肝气协助蓄藏气血、阴精肾气推动、肝气疏泄输送而至胞宫。
4 冲任二脉同脾的关系
脾为后天之本，气血生化之源，并主摄血、统血。脾的运化功能正常，气血生化有源，冲任二脉才能有血可蓄。而脾气健旺，统摄有度，就能协助冲任蓄藏气血，使其蓄藏有度，而不致发生妄行，以保证冲任二脉的功能活动能够正常进行。如脾运正常水谷生化气血十二正经冲任脾气健旺、统摄有度蓄藏有度。