在公布Switch 2主机时，任天堂宣布Switch 2将兼容当前的Switch游戏，但警告，并非每款游戏都能在新主机上完全运行。
在Switch 2预告片结尾，任天堂展示一条信息，确认Switch 2“可游玩Switch 2独占游戏，以及任天堂Switch 游戏”。
随后进一步澄清，这不仅限于实体游戏卡带，还补充道：“任天堂Switch 2可游玩实体和数字版Switch游戏。”
然而，信息中也提到兼容性并非100%，并警告称：“某些任天堂Switch游戏可能无法在Switch 2上运行，或者无法完全兼容。”
尽管这可能让玩家感到担忧，但这一警告可能仅仅是指由于硬件变化而无法在Switch 2上运行的游戏。
例如，Switch上的Labo系列游戏需要玩家将主机和Joy-Con手柄插入各种纸板配件中使用。由于Switch 2和其 Joy-Con手柄的形状与前代不同，Labo很可能无法在Switch 2上运行。
目前还不清楚Switch 2的Joy-Con手柄是否保留了Switch右侧Joy-Con上的红外摄像头功能。如果没有这些功能，这些依赖红外摄像头的游戏将无法在Switch 2上运行（除非Switch 2支持无线连接Switch Joy-Con手柄）。
其他使用专属外设的游戏也可能与Switch 2不兼容，这取决于它们如何与主机连接，不过这些细节可能会在稍后公布。
类似的限制在以前支持向下兼容的游戏主机上也出现过。例如，尽管Xbox Series X/S几乎可以运行所有Xbox One游戏，但它无法支持需要Kinect感应器的Xbox One游戏，因为Series X/S不支持这一外设。