在《文明6》这款策略类游戏中，每个国家都有其独特的地理位置和资源分布，关于哪座城市与虚拟首都距离最近的问题并没有一个确定的答案，因为这取决于玩家所选择的地图、文明以及在游戏中的具体布局和战略决策。

不过，我们可以从地理战略优势的角度来探讨这个问题，在游戏中，具有优势的地理位置通常意味着更容易获取资源、更便利的交通网络以及更有利的防御态势，以下是一些可能影响城市间距离和地理战略优势的因素：

1、地图类型：《文明6》提供了多种类型的地图，如沙漠、极地、绿洲等，每种地形都有不同的特点和挑战，选择合适的地图对于制定合适的战略至关重要，某些地图可能更适合发展农业或工业，而另一些则可能更有利于探险和征服，在选择地图时，玩家需要考虑自己的游戏风格和战略目标。

2、资源分布：了解地图上的主要资源和其分布情况对于确定初始发展策略至关重要，如果某个地区拥有丰富的自然资源（如矿产、食物和水源），那么在该地区建立城市将能够更快地实现经济增长和人口扩张，在选择首都位置时，玩家需要权衡资源的可得性和城市的战略布局需求。

3、地形特点：分析地图上的地形特征也是至关重要的，山脉、河流和其他自然屏障可以提供额外的防御保护，但同时也可能对交通造成一定的阻碍，平原地区虽然交通便利，但也可能更容易受到敌人的攻击，在确定首都的位置时，玩家需要综合考虑这些因素并做出明智的决策。

4、文明特性：不同的文明拥有各自独特的特点和能力，有些文明的淡水不能增加住房数量（如玛雅），而有些文明则在沿海地区能够获得额外加成（如澳大利亚），这些差异可能会影响玩家的首都选址和城市发展规划，如果一个文明擅长海上贸易和殖民活动，那么选择一个靠近海岸线的首都可能会更加有利。

5、交通网络：建立一个高效的交通网络是确保首都与其他城市之间快速沟通和物资运输的关键，这包括修建道路、铁路和港口等设施，通过优化交通网络设计，可以缩短城市间的旅行时间并提高整体效率。

《文明6》中哪座城市与虚拟首都距离最近并不是一个固定不变的问题；它取决于多个因素的综合影响，为了最大化利用地理战略优势，玩家需要在选择首都位置和规划城市发展时仔细考虑上述因素并根据实际情况进行灵活调整。